相同点：

1. 都是面向对象的语言；
2. 都可以开发桌面应用程序和服务端应用程序；
3. 都有大量的API来支持开发者；
4. 都可以在多平台上运行。

不同点：

1. Java是一门独立的语言，而C#是基于Microsoft .NET Framework的语言；
2. Java使用JVM来执行代码（Java Virtual Machine) ，而C#则使用CLR (Common Language Runtime) 来执行代码；
3. Java的泛型实现方式为原始数据类型安全保障更好,而C#则使用了特性(Attributes)来实现泛型保障 ；
4. C#中有LINQ(Language Integrated Query), 这是一个集成在语言中的SQL风格的数据处理功能, 这在Java中并不存在。