黑木耳的培养基配方可以根据不同的研究目的而有所不同。一般情况下，黑木耳的培养基可以由多种原料混合制成，包括蛋白质、脂肪、微量元素、氨基酸、多种水溶性无机盐和适当量的抗生素。例如：牛血清胆囊去壳球菌（Bacillus subtilis）20.0 g/L + 蔗糖 20.0 g/L + 硫酸钙 0.2 g/L + 氯化钠 5.0 g/L + 尿囊宁 0.05g/L + 去氧核糖核酸 1.0 g/L。