可以使用Java编写一个算法来判断在给定的排列中，元素y是否与其相邻。以下是一个示例代码：

import java.util.Scanner;

public class CheckAdjacentElement {
    public static void main(String[] args) {
        Scanner scanner = new Scanner(System.in);
        
        // 输入排列的长度
        int n = scanner.nextInt();
        
        // 输入排列的元素
        int[] arr = new int[n];
        for (int i = 0; i < n; i++) {
            arr[i] = scanner.nextInt();
        }
        
        // 输入要判断的元素和y
        int c = scanner.nextInt();
        int y = scanner.nextInt();
        
        // 判断元素y是否与其相邻
        boolean isAdjacent = false;
        for (int i = 0; i < n - 1; i++) {
            if ((arr[i] == c && arr[i + 1] == y) || (arr[i] == y && arr[i + 1] == c)) {
                isAdjacent = true;
                break;
            }
        }
        
        // 输出结果
        if (isAdjacent) {
            System.out.println("元素" + c + "和" + y + "是相邻的");
        } else {
            System.out.println("元素" + c + "和" + y + "不是相邻的");
        }
    }
}

这个算法首先读取输入的排列长度n，然后读取排列的元素，最后读取要判断的元素c和y。接下来，它使用一个循环遍历排列中的元素，判断是否有相邻的元素是c和y。如果找到了相邻的元素，将isAdjacent标记为true，然后输出结果。

请注意，这只是一个简单的示例代码，没有进行输入验证和错误处理。在实际应用中，你可能需要添加适当的输入验证和错误处理来确保程序的稳定性和正确性。