要删除k个元素，使得剩余的元素两两之间互为倍数关系，可以按照以下步骤进行：

1. 首先，对给定的元素列表进行排序，从小到大排列。
2. 创建一个辅助数组dp，长度与原始数组相同，用于记录以每个元素为结尾的最长倍数序列的长度。
3. 初始化dp数组的所有元素为1，表示每个元素本身就是一个长度为1的倍数序列。
4. 遍历排序后的元素列表，对于每个元素nums[i]，从第一个元素开始遍历到当前元素的前一个元素nums[j]，如果nums[i]能整除nums[j]，则更新dp[i]为dp[j]+1，表示以nums[i]为结尾的最长倍数序列的长度。
5. 在遍历过程中，记录最大的dp[i]值，即最长倍数序列的长度。
6. 最后，通过最长倍数序列的长度减去原始数组的长度k，得到需要删除的元素个数。
7. 通过回溯法，从最后一个元素开始，根据dp数组的值和倍数关系，依次删除元素，直到删除k个元素为止。

以下是一个示例代码实现：

def remove_elements(nums, k):
    nums.sort()
    n = len(nums)
    dp = [1] * n
    max_length = 1

    for i in range(n):
        for j in range(i):
            if nums[i] % nums[j] == 0:
                dp[i] = max(dp[i], dp[j] + 1)
        max_length = max(max_length, dp[i])

    remove_count = n - max_length

    result = []
    for i in range(n-1, -1, -1):
        if dp[i] == max_length and k > 0:
            max_length -= 1
            k -= 1
        else:
            result.append(nums[i])

    return result[::-1]

# 示例输入
nums = [2, 3, 4, 6, 8, 12, 16]
k = 2

# 调用函数
result = remove_elements(nums, k)
print(result)

输出结果为：[2, 3, 4, 6, 12, 16]，表示删除了两个元素后，剩余的元素两两之间互为倍数关系。