创新创业课程的奖惩制度可以根据学校的具体情况来制定。例如，可以设立“湖南科技大学土木工程学院大学生创新创业基金”(简称双创基金),用以资助和奖励学生学术、科技及竞赛活动。此外，还可以制定“创业型企业奖惩制度”，对员工的奖惩实行以精神鼓励和思想教育为主、经济奖惩为辅的原则。