增值税是一种间接税，根据OECD的标准，理论上应该中性公平，即简化档次，一档税率最好。 但是我国现行的增值税制度中存在13%、9%、6%三档税率的主要原因是我国经历过两次大的营改增，为了避免对企业生产经营造成过大影响，采取了分档征收的方式。

因此，增值税实行不同税率并不违反公平性原则。但是，有人认为这种分档征收方式会导致一些企业负担过重，而另一些企业则负担过轻。