儒家文化对中医药的影响是深远的。儒家哲学的思维方式和某些核心理念被中医学吸收和应用，构成了中医学的理论来源及其根本原则，对中医学的理论和临床实践都产生了重大而深远的影响 。

例如，儒家的“中庸之道”奠定了中医阴阳平衡观念：以阴平阳秘为身体健康的标准，视失中违和为疾病发病的机理，立调和致中为治疗疾病的原则。

此外，儒家“仁爱”思想促进中医伦理道德的形成。