我国产业体系建设存在的主要短板包括：传统产业转型滞缓与新兴产业发展不充分。建设现代化产业体系重在补短板、锻长板，确保产业体系自主可控、安全可靠，力争在全球产业链布局和国际分工中占据有利位置。