我国产业体系建设的短板主要包括：传统产业转型滞缓与新兴产业发展不充分，一些传统行业中，企业规模过小、结构单一，金融支持转型发展不够，企业附加值低，缺乏核心竞争力；自主创新能力不足；资源消耗和污染物排放较大；发展不平衡不充分问题比较突出等 。