我国产业体系建设存在的主要短板包括：传统产业转型滞缓与新兴产业发展不充分，一些传统行业中，企业规模过小、结构单一，金融支持转型发展不够，企业附加值低，缺乏核心竞争力。例如纺织服装行业产品质量不高，品牌认知度较低；钢铁行业产生大量污染物排放给环境带来了很大的负担，绿色化转型难度大；石化行业受长期粗放式增长模式影响，结构性问题日益突出，化工产品仍以中低端为主。

此外，现代服务业既是我国产业体系的短板，也是产业结构优化升级的方向。我国无论在生产性服务业还是生活性服务业方面都需要补课。一方面，要紧紧围绕农业和制造业转型升级的服务需求，推动生产性服务业向专业化和价值链高端延伸，加快发展研发设计、现代物流、检验检测、法律服务等服务业，促进现代服务业同先进制造业、现代农业深度融合；另一方面，要紧扣满足人民日益增长的美好生活向往，以标准化、品牌化、数字化为引领，推动生活性服务业向高品质和多样化升级。