SWK序列可以帮助识别和检测可能存在于杂交瘤中的新基因，通过找出具有相似特征的DNA序列，然后用它们来搜索杂交瘤的基因组，以发现未被记录在数据库中的新基因。SWK序列也可以用于鉴定不同样本之间已知或未知的新基因表达差异。