脚踝骨折手术后两个月大脚趾不能自主动可能是由于以下原因：

1. 神经损伤：手术过程中可能会损伤到足底神经，导致大脚趾无法自主动。
2. 肌肉萎缩：长时间的卧床休息和缺乏运动会导致肌肉萎缩，影响大脚趾的活动能力。
3. 关节僵硬：手术后长时间固定可能导致关节僵硬，影响大脚趾的活动能力。

针对这种情况，应该采取以下措施：

1. 进行物理治疗：可以进行按摩、理疗、热敷等物理治疗，促进血液循环和肌肉恢复。
2. 进行康复训练：可以进行一些简单的康复训练，如踮脚尖、踩脚跟等，帮助恢复大脚趾的活动能力。
3. 注意饮食和营养：保证足够的蛋白质和维生素摄入，有助于肌肉恢复和神经修复。
4. 避免长时间固定：在康复期间要避免长时间固定，可以适当活动受伤部位，促进关节灵活度。